A origem do nome do Município de Descanso deve-se a passagem da Coluna Prestes, que cruzou este Território em 1925. Pelo fato de terem descansado no município, a própria Coluna Prestes denominou o nome ao município.
Na época era apenas sertão bravio, e a colonização só teve início em 1934 com a chegada dos primeiros colonizadores, a maioria de origem Polonesa vindos do Rio Grande do Sul. O objetivo destes colonizadores era a terra doada em troca de caminhos abertos, contudo, o objetivo principal era a extração da madeira de cedro e pinheiro.
Como em todas as cidades do extremo Oeste Catarinense, quem chegou primeiro foi o madeireiro, pela trilha da Coluna Prestes levava a madeira através do Rio Peperi-Guaçu até a Argentina. O colonizador veio após o madeireiro. A Empresa Madeireira de Chapecó - Peperi vendeu as primeiras 50 colonias para Martins Piaseski, Ludovico Wronski e Antonio Ciecanoski, que lideraram o primeiro núcleo formado no local.
Em 1953, com o desmembramento do Município de Chapecó, o Distrito passou a pertencer ao Município de Mondaí. Através da Lei Estadual nº 254 de 12 de setembro, é criado o Município de Descanso, sendo instalado a 16 de dezembro de 1956.