O município de Barra Bonita desmembrou-se do município de São Miguel do Oeste, foi criado através da lei n.º 10.052 de 29 de dezembro de 1995. A consulta plebiscitaria realizou-se no dia 17 de dezembro de 1995. Através de voto eletrônico 946 pessoas votaram, sendo que 862 votaram pela emancipação. O nome de barra bonita surgiu segundo os primeiros moradores, devido a beleza do rio das Antas. Foi dado então o nome de Barra Bonita ao rio e a comunidade. Os desbravadores eram agricultores, em sua maioria descendentes italianos, vindos do Rio Grande do Sul no lombo de mulas ou em pequenos caminhões por volta do ano de 1951.

Em 19 de dezembro de 1960 Barra Bonita passou a ser distrito, tendo como primeiro intendente o Sr. Ângelo Benetti. O primeiro padre foi Aurélio Canzi. Nos primeiros anos, os cultos e missas eram realizados na casa do Sr. Antônio Dresch. A primeira igreja foi edificada em 1959, no mesmo local onde se encontra a atual. O seu padroeiro é São Francisco de Assis.

Os primeiros moradores a se fixarem em Barra Bonita foram: João Giacomelli, José Zanotti, Arlindo Eberart, Vicente Vitcoscki, Balduíno Friederichs, David Sarzi, Antônio Dresch, Rosa Vitcoski, Regina Rapac, Ângelo Benetti, Pascoal Moura, Arlindo Boff e outros.

A primeira casa comercial a se estabelecer era um armazém de primeiras necessidades de propriedade do Sr. Honório Caneppele. O primeiro casamento realizado no cartório civil foi de Ataíde Sarzi e Solange Caneppele. O primeiro registro de nascimento foi de Ivanete Matilde Stürmer, filha de Francisco Stürmer e Anata Stürmer.